Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF39Q9H2S5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF39Q9H2S5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF39Q9H2S5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF39Q9H2S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF39Q9H2S5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF39Q9H2S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms