Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC68Q9H2F9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC68Q9H2F9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC68Q9H2F9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms