Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH9Q9H1X1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RSPH9Q9H1X1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RSPH9Q9H1X1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms