Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB17Q9H0T7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB17Q9H0T7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms