Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF541Q9H0D2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF541Q9H0D2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF541Q9H0D2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF541Q9H0D2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms