Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM6SF1Q9BZW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM6SF1Q9BZW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TM6SF1Q9BZW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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