Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GTPBP4Q9BZE4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTPBP4Q9BZE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTPBP4Q9BZE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTPBP4Q9BZE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTPBP4Q9BZE4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTPBP4Q9BZE4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GTPBP4Q9BZE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms