Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CELF4Q9BZC1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CELF4Q9BZC1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CELF4Q9BZC1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CELF4Q9BZC1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms