Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL392023.2-201ENST00000554687 785 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP4-8Q9BYQ9 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms