RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.58■■■□□ 2.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXD1Q16676 465 aa26■■□□□ 1.75
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MSH5O43196 834 aa24.59■■□□□ 1.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEDQ86YR6 584 aa24.58■■□□□ 1.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.31■■□□□ 1.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.97■■□□□ 1.43
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADRA2BP18089 450 aa23.9■■□□□ 1.42
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.05■■□□□ 1.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.22■□□□□ 0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.22■□□□□ 0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.94■□□□□ 0.94
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF39Q9H2S5 420 aa20.89■□□□□ 0.93
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.48■□□□□ 0.87
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CAPN15O75808 1086 aa19.49■□□□□ 0.71
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DSG3P32926 999 aa19.41■□□□□ 0.7
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNA4P22459 653 aa19.22■□□□□ 0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEHQ6S545 545 aa19.22■□□□□ 0.67
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 APLP2Q06481 763 aa19.18■□□□□ 0.66
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC4A2P04920 1241 aa19.14■□□□□ 0.65
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABCB7O75027 752 aa18.95■□□□□ 0.62
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POLA2Q14181 598 aa18.46■□□□□ 0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.33■□□□□ 0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.11■□□□□ 0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AKT1S1Q96B36 256 aa18.08■□□□□ 0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OSCARQ8IYS5 282 aa17.85■□□□□ 0.45
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.78■□□□□ 0.44
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PITPNM1O00562 1244 aa17.68■□□□□ 0.42
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.63■□□□□ 0.41
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB22O15209 634 aa17.62■□□□□ 0.41
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HAX1O00165 279 aa17.61■□□□□ 0.41
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.61■□□□□ 0.41
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBLN2P98095 1184 aa17.51■□□□□ 0.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.49■□□□□ 0.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE6P0CI01 402 aa17.49■□□□□ 0.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.49■□□□□ 0.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.28■□□□□ 0.36
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EVX2Q03828 476 aa17.25■□□□□ 0.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.16■□□□□ 0.34
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C19orf67A6NJJ6 358 aa17.06■□□□□ 0.32
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRR29P0C7W0 189 aa16.95■□□□□ 0.3
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHADLQ6NUI6 762 aa16.92■□□□□ 0.3
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GABBR2O75899 941 aa16.91■□□□□ 0.3
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LHX8Q68G74 356 aa16.73■□□□□ 0.27
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLCN6P51797 869 aa16.63■□□□□ 0.25
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEIP0CG38 1075 aa16.48■□□□□ 0.23
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.48■□□□□ 0.23
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.46■□□□□ 0.23
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.44■□□□□ 0.22
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.39■□□□□ 0.21
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CREBZFQ9NS37 354 aa16.36■□□□□ 0.21
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.27■□□□□ 0.2
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PHF12Q96QT6 1004 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OTUD5Q96G74 571 aa15.99■□□□□ 0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.99■□□□□ 0.15
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTEB2H3BUK9 544 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.85■□□□□ 0.13
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC39A7Q92504 469 aa15.83■□□□□ 0.12
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 METRNQ9UJH8 293 aa15.83■□□□□ 0.12
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