Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPS2Q9BXY5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPS2Q9BXY5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms