Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUSAP1Q9BXS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUSAP1Q9BXS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUSAP1Q9BXS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms