Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PINK1Q9BXM7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PINK1Q9BXM7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PINK1Q9BXM7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms