Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDCA4Q9BXL8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDCA4Q9BXL8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms