Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF20Q9BVI0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF20Q9BVI0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF20Q9BVI0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF20Q9BVI0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms