Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PI4K2AQ9BTU6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PI4K2AQ9BTU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PI4K2AQ9BTU6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms