Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A3Q9BRY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A3Q9BRY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A3Q9BRY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms