Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM2D3Q9BRN9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms