Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOXF2Q9BQY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHOXF2Q9BQY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms