Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MGME1Q9BQP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGME1Q9BQP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGME1Q9BQP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms