Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LPIN3Q9BQK8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPIN3Q9BQK8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPIN3Q9BQK8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms