Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C19orf43Q9BQ61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C19orf43Q9BQ61 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C19orf43Q9BQ61 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C19orf43Q9BQ61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C19orf43Q9BQ61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C19orf43Q9BQ61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms