Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms