Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CITED1Q99966 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CITED1Q99966 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms