Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPAS1Q99742 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms