Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP8Q99708 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP8Q99708 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP8Q99708 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms