Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHP1Q99653 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHP1Q99653 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms