Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF18Q99633 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF18Q99633 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms