Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A3Q99624 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A3Q99624 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms