Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGMNQ99538 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms