Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD180Q99467 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD180Q99467 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD180Q99467 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD180Q99467 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD180Q99467 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD180Q99467 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD180Q99467 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD180Q99467 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD180Q99467 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD180Q99467 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD180Q99467 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD180Q99467 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD180Q99467 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD180Q99467 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD180Q99467 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD180Q99467 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD180Q99467 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD180Q99467 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD180Q99467 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD180Q99467 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD180Q99467 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD180Q99467 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD180Q99467 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD180Q99467 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD180Q99467 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD180Q99467 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD180Q99467 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD180Q99467 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD180Q99467 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD180Q99467 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD180Q99467 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD180Q99467 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD180Q99467 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms