Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT12Q99456 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT12Q99456 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms