Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHOX2BQ99453 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHOX2BQ99453 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms