Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF3RQ99062 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF3RQ99062 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms