Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPK1Q96SB4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms