Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP1R9BQ96SB3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPP1R9BQ96SB3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R9BQ96SB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R9BQ96SB3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms