Protein–RNA interactions for Protein: Q96S59

RANBP9, Ran-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP9Q96S59 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP9Q96S59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RANBP9Q96S59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RANBP9Q96S59 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RANBP9Q96S59 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RANBP9Q96S59 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms