Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PIGSQ96S52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PIGSQ96S52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIGSQ96S52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PIGSQ96S52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PIGSQ96S52 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PIGSQ96S52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIGSQ96S52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIGSQ96S52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIGSQ96S52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIGSQ96S52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIGSQ96S52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIGSQ96S52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGSQ96S52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGSQ96S52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PIGSQ96S52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGSQ96S52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIGSQ96S52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIGSQ96S52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIGSQ96S52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIGSQ96S52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PIGSQ96S52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIGSQ96S52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIGSQ96S52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIGSQ96S52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIGSQ96S52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIGSQ96S52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PIGSQ96S52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIGSQ96S52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PIGSQ96S52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIGSQ96S52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PIGSQ96S52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PIGSQ96S52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PIGSQ96S52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIGSQ96S52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms