Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
IFT140Q96RY7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
IFT140Q96RY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
IFT140Q96RY7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
IFT140Q96RY7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
IFT140Q96RY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms