Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PANX1Q96RD7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PANX1Q96RD7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PANX1Q96RD7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms