Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALPK1Q96QP1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK1Q96QP1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms