Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRNT1Q96Q11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRNT1Q96Q11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNT1Q96Q11 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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