Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LMTK3Q96Q04 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMTK3Q96Q04 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
LMTK3Q96Q04 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms