Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPG4P5Q96PW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPG4P5Q96PW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms