Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCEEQ96PE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCEEQ96PE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms