Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP4Q96P64 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP4Q96P64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP4Q96P64 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms