Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP3Q96P20 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP3Q96P20 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NLRP3Q96P20 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP3Q96P20 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms