Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH12Q96NR8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH12Q96NR8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms