Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JSRP1Q96MG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JSRP1Q96MG2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
JSRP1Q96MG2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms