Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
STAC3Q96MF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
STAC3Q96MF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAC3Q96MF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STAC3Q96MF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
STAC3Q96MF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAC3Q96MF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAC3Q96MF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
STAC3Q96MF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms